Investigação Computacional do Mecanismo Catalítico da nsP2 do Vírus Chikungunya (CHIKV)
Cisteina protease; nsP2; Chikungunya
A proteína nsP2 do vírus Chikungunya (CHIKV), uma protease de cisteína, é uma enzima essencial para o ciclo de vida do vírus . Portanto, compreender o funcionamento dessa enzima em nível molecular é crucial para o desenvolvimento futuro de novos inibidores. Na presente dissertação, investigamos exclusivamente o mecanismo enzimático da nsP2. Utilizamos Simulações de Dinâmica Molecular (DM) e abordagem de cluster, uma metodologia que utiliza Mecânica Quântica (MQ), para estudar a reação enzimática no sítio ativo da nsP2, especificamente a desprotonação do resíduo Cys478 pela resíduo His548. Além disso, consideramos como a presença de uma molécula de água pode catalisar essa reação. Nossos resultados indicam que a presença dessa molécula de água auxilia na formação do par iônico Cys− His+. Esses cálculos permitiram obter um quadro dos possíveis caminhos de reação para essa enzima, incluindo detalhes do mecanismo de reação e suas correspondentes barreiras de ativação. Conhecer detalhadamente o alvo enzimático e fundamental para o desenvolvimento de inibidores eficazes, pois permite a identificação de pontos críticos no mecanismo de ação da enzima que podem ser explorados para a criação de moléculas que interfiram especificamente no funcionamento do alvo2. Esta compreensão molecular fornece uma base sólida para o design racional de futuros inibidores com potencial aplicação no tratamento da febre CHIKV. A pesquisa contínua sobre o mecanismo enzimático e a interação entre o sítio ativo da nsP2 e possíveis inibidores será crítico para o desenvolvimento de terapias antivirais eficazes.