Investigação Computacional do Mecanismo Catalítico da nsP2 do Vírus Chikungunya (CHIKV)
Cisteína protease; nsP2; Chikungunya.
A proteína nsP2 do vírus Chikungunya (CHIKV), uma cisteíno protease essencial para o ciclo de vida do vírus, pois está envolvida com o complexo de replicação viral. Portanto, compreender o funcionamento dessa enzima em nível molecular é crucial para o desenvolvimento futuro de novos inibidores. Na presente dissertação, investigamos exclusivamente o mecanismo enzimático da nsP2. Utilizamos simulações de dinâmica molecular (DM) em abordagem de cluster, uma metodologia que utiliza mecânica quântica (MQ) para estudar a reação enzimática no sítio ativo da nsP2, especificamente a desprotonação do resíduo Cys478 pela resíduo His548. Além disso, verificamos se a presença de uma molécula de água pode catalisar essa reação de ativação da enzima. Nossos resultados indicam que a presença de uma molécula de água promove a formação do par iônico catalítico. Esses cálculos permitiram obter um quadro dos possíveis caminhos de reação, incluindo detalhes do mecanismo de reação e suas correspondentes barreiras de ativação. Conhecer detalhadamente o alvo enzimático é fundamental para o desenvolvimento de inibidores eficazes, pois permite a identificação de pontos críticos no mecanismo de ação da enzima que podem ser explorados para a criação de moléculas que interfiram especificamente no funcionamento do alvo. Esta compreensão molecular fornece uma base sólida para o design racional de futuros inibidores com potencial aplicação no tratamento da febre CHIKV. A pesquisa continua em andamento e focando no mecanismo enzimático e na interação entre o sítio ativo da nsP2 e possíveis inibidores.