Banca de DEFESA: DANIEL DE SOUZA SANTOS

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : DANIEL DE SOUZA SANTOS
DATA : 11/04/2025
HORA: 09:00
LOCAL: CRAD - UFAL Arapiraca
TÍTULO:

MAPEAMENTO GENÉTICO EM Spondias tuberosa Arruda USANDO SEQUENCIAMENTO DE CÉLULAS UNICAS

PALAVRAS-CHAVES:

Recombinação meiótica; Expressão gênica; Citogenética; Bioinformática.

PÁGINAS: 57
RESUMO:

Objetivou-se com essa pesquisa construir um mapa genético de Spondias tuberosa Arruda, utilizando a técnica de sequenciamento de RNA de célula única (scRNA-seq) para caracterizar eventos de recombinação meiótica e identificar polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs). O umbuzeiro é uma espécie nativa do Brasil, amplamente distribuída nos biomas Caatinga e Cerrado, com relevante importância ecológica, socioeconômica e cultural, principalmente para as comunidades do semiárido. No entanto, devido à exploração extrativista e às condições climáticas adversas, sua variabilidade genética ainda é pouco compreendida, tornando essencial a aplicação de ferramentas genômicas para sua conservação e melhoramento. O material utilizado para coleta de pólen foi propagado de forma vegetativa e cultivado em cada de vegetação no Max Planck Institute para Plant Breeding Research in Cologne, Alemanha e o pólen foi coletado para sequenciamento de gametas. O mesmo foi isolado por filtração e citometria de fluxo, garantindo a viabilidade celular antes do sequenciamento. As bibliotecas genômicas foram preparadas com a plataforma 10x Genomics e sequenciadas em o Illumina NovaSeq. O pipeline incluiu o pré-processamento das leituras, mapeamento ao genoma de referência, detecção de SNPs, construção de haplótipos e identificação de eventos de crossing-over, utilizando ferramentas como minimap2, bcftools, SHOREmap e TIGER. Conclui-se que o uso do scRNA-seq se mostrou uma estratégia robusta para mapear eventos de recombinação na espécie. Os resultados indicam uma distribuição heterogênea desses eventos, com regiões de alta densidade gênica apresentando maior frequência de crossing over e baixa concentração de sequências repetitivas (satDNA) e significativa frequência de SNPs, enquanto os coldspots acumulam poucos SNPs e elevada incidência de DNA satélite e TEs. Essa dinâmica sugere que a organização dos genes e a troca de material genético estão intrinsecamente ligadas à diversidade interna da espécie, contribuindo para sua adaptação e evolução. Além disso, a predominância de elementos genômicos exclusivos reforça a existência de funções e origens distintas entre eles.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1181648 - JOSE VIEIRA SILVA
Interno(a) - 2380775 - CICERO CARLOS DE SOUZA ALMEIDA
Interno(a) - 1543863 - CICERO GOMES DOS SANTOS
Externo(a) à Instituição - RUBENS PESSOA DE BARROS - UNEAL