Associação entre ritmo circadiano, câncer e diabetes utilizando ferramentas da bioinformática
genes do relógio, IGF1, USP2, síndrome metabólica, hipotálamo, córtex, câncer
Introdução: A tumorigênese é afetada pelos genes do relógio. Alterações da expressão dos genes do relógio podem aumentar a susceptibilidade ao câncer através dos efeitos nos mecanismos biológicos que regulam o dano e reparo ao DNA, o metabolismo energético, crescimento e morte celular em tecidos neoplásicos. Objetivo: analisar a associação do ritmo circadiano, diabetes tipo 2 e câncer. Metodologia: O estudo é uma meta-análise realizada em amostras de tecido de paciente com diabetes tipo 2 e amostras de tecido normal, genes relacionados ao ritmo circadiano e dados do transcriptoma associado ao câncer de mama, bexiga, fígado, pâncreas, cólon e reto usando a integração de perfis de expressão gênica com biomolecular em escala de genoma redes em amostras de diabetes, os bancos de dados pesquisados foram o Pubmed e TCGA. Foram utilizados os descritores Ritmo circadiano, Diabetes tipo 2 e câncer em inglês com operadores boleanos and ou or. Resultados: KLF10, NTKR3, IGF1, USP2, EZH2 foram regulados negativamente em amostras de diabetes tipo 2 e câncer, enquanto ARNTL2 E AGRP foram regulados positivamente. Parece que as alterações no mRNA estão contribuindo para as alterações fenotípicas no diabetes tipo 2, resultando em alterações fenotípicas associadas à transformação maligna. Tomando esses genes para realizar uma análise de sobrevivência, encontramos apenas os genes IGF1, USP2 e ARNTL2 associados aos resultados dos pacientes.Enquanto a regulação negativa de IGF1 e USP2 teve um impacto negativo, a regulação positiva de ARNTL2 foi associada a uma pior sobrevida em amostras de câncer BLCA e BRCA. Conclusão: nossos dados estimulam esforços em novos estudos para alcançar a validação experimental e clínica sobre essas biomoléculas.