Banca de QUALIFICAÇÃO: JOSE ALEX CARVALHO DE FARIAS

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : JOSE ALEX CARVALHO DE FARIAS
DATA : 28/11/2024
HORA: 14:00
LOCAL: ICBS - SALA 20
TÍTULO:

INTEGRAÇÃO DE DADOS DE SINGLE-CELL RNA-seq e TRANSCRIPTOMA
ESPACIAL PARA INVESTIGAÇÃO DO RITMO CIRCADIANO NO CÂNCER DE
MAMA

PALAVRAS-CHAVES:

câncer de mama; scRNA-seq; ritmo circadiano

PÁGINAS: 62
RESUMO:

O câncer de mama (CM) é o segundo tipo de tumor mais frequentemente diagnosticado depois do
câncer de pulmão, sendo o mais comum entre adultos com mais de 2,3 milhões de casos a cada ano.
Alterações na homeostasia do sistema circadiano causadas por mutações em determinados genes do
relógio podem resultar em mudanças na proliferação celular, danos ao DNA e no metabolismo, assim
como os diferentes CCGs (clock controlled genes) estão envolvidos na regulação do ciclo celular e em
processos carcinogênicos. Portanto, o surgimento do câncer de mama também está relacionado com
alterações na expressão gênica de células reguladas por genes relógio e suas variações rítmicas. Este
estudo teve como objetivo investigar alterações no ritmo circadiano em amostras câncer de mama
usando dados integrados do scRNA-seq e do transcriptoma espacial. A metodologia utilizada envolveu
diversas ferramentas computacionais que envolveu a coleta dos dados em bancos de dados como o
GTEx e o TCGA e análises de dados do RNA-seq, scRNA-seq e transcriptoma espacial de amostras
de tecido normal e neoplásico do câncer de mama. Com relação a análise de correlação entre as
mudanças no ciclo circadiano e os subtipos do câncer de mama (Luminal A, Luminal B, HER2+ e TNBC)
foi observado um aumento progressivo da desregulação em todos os subtipos, com o subtipo TNBC
mostrando uma maior alteração no ritmo circadiano, enquanto o subtipo Luminal B mantém uma
organização temporal mais próxima do tecido normal. O CRDscore nos diferentes grupos de células
epiteliais cancerígenas e normais demonstrou que os subtipos HER2+ e ER+ mostram uma regulação
circadiana perturbada, refletida em maiores escores de CRD. O pseudotime apresentou transições
fenotípicas na progressão das células neoplásicas e uma regulação gênica de genes ativados e
reprimidos ao longo da progressão tumoral. Ainda nessa análise, genes associados a vias biológicas
como progressão tumoral e resposta imune também apresentaram alterações dinâmicas ao longo da
evolução das células neoplásicas. As análises do TE dos nossos dados demonstram um aumento de
genes circadianos em áreas específicas dos subtipos HER2+, ER+ e TNBC, sugerindo que o ritmo
circadiano pode influenciar no comportamento tumoral. Estas correlações direcionam para uma
possível desregulação do ritmo circadiano no ambiente tumoral, o que pode estar associado a uma
biologia tumoral mais agressiva ou a uma resposta diferenciada aos tratamentos.

MEMBROS DA BANCA:
Interno(a) - 1867374 - ELAINE VIRGINIA MARTINS DE SOUZA FIGUEIREDO
Interno(a) - 1046888 - MARCIO BEZERRA SANTOS
Externo(a) ao Programa - 2272670 - ALINE CAVALCANTI DE QUEIROZ - UFALExterno(a) ao Programa - 2585610 - KAROL FIREMAN DE FARIAS - UFAL