Em 2022, o estado de Alagoas, localizado na região Nordeste do Brasil, registrou um aumento expressivonos casos de febre chikungunya, com a capital Maceió representandocomo o segundo município com maior número de notificações de casos prováveis no país. A vigilância genômica de regiões com potencial epidêmico, como Alagoas, contribui para a compreensão da dispersão viral, bem como para predizer e controlar novas epidemias. Neste contexto, este estudo realizou o sequenciamentode genoma completo de 68 amostras de CHIKV coletadasem Alagoas nos anos de 2016, 2022, 2023 e 2024. A análise filogenética dessas sequências revelou a presença de quatro clusters distintos,sugerindo a ocorrência de múltiplos eventos de introdução independente de CHIKVno estado. Foram identificadasmutações associadas a repercussõesna transmissibilidade e patogenicidade do CHIKV, bem como mutações não sinônimas com repercussões biológicas ainda a ser esclarecidas. Em resumo, considerando a necessidade de ampliar os esforços para a vigilância global das arboviroses, nosso estudo contribui para o fortalecimento da vigilância genômica do CHIKV, gerando dados que poderão subsidiar futuros estudos e ações de saúde pública.