Banca de DEFESA: MARIA THALILLIAN SANTOS FIGUEIREDO

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : MARIA THALILLIAN SANTOS FIGUEIREDO
DATA : 17/04/2024
HORA: 14:00
LOCAL: Auditório do CRAD, Campus de Arapiraca, UFAL
TÍTULO:

Anotação genômica da fração repetitiva de Syagrus coronata obtida por meio de montagem de Genoma Skimming

PALAVRAS-CHAVES:

Ouricuri; DNA repetitivo; comprimento do genoma.

PÁGINAS: 50
RESUMO:

Os genomas das plantas variam consideravelmente em tamanho e composição, sendo o DNA repetitivo o fator mais crucial na diversidade, representando até 90% do genoma e, do qual o DNA repetitivo consiste em elementos satélites e transponíveis. Syagrus coronata é uma palmeira endêmica do Brasil pertencente à família Arecaceae. Sua distribuição geográfica inclui as regiões da Caatinga e da Mata Atlântica. Atualmente, existem estudos de genomas de cloroplastos e mitocondriais, bem como de marcadores microssatélites do genoma nuclear. No entanto, a dinâmica e a evolução do genoma nuclear, incluindo o tamanho do genoma e a composição repetitiva do DNA, não são bem compreendidas. Este estudo tem como objetivo estimar o tamanho do genoma e caracterizar sequências repetitivas em S. coronata. O tamanho do genoma foi estimado usando citometria de fluxo e abordagens k-mer. Sequências repetitivas foram analisadas usando leituras pareadas através de pipeline RepeatExplorer, e as espécies Syagrus weddelliana e Cocos nucifera foram incluídas para comparação genômica. O tamanho do genoma foi estimado em 2,27±0,026 Gbp/1C usando citometria de fluxo e estimativas usando k-mer mostraram 1,2 Gb. A análise repetitiva mostrou que as sequências repetitivas representam 58,43% do genoma de S. coronata, sendo os retrotransposons LTR os mais abundantes (48,71%). Dentre os retrotransposons LTR, o Angela foi o mais abundante, com 25,66%. Outros elementos repetitivos, como transposons, DNA ribossômico e sequências satélites, exibiram níveis mais baixos de repetição. Os satélites exibiram alta diversidade em número e comprimento de monômeros; no entanto, eles deram uma pequena contribuição para o tamanho do genoma. Concluímos que S. coronata possui um genoma com sequências de DNA moderadamente repetitivas, sendo os retrotransposons LTR os mais abundantes.

MEMBROS DA BANCA:
Interno(a) - 3073207 - ANDRE SECO MARQUES DA SILVA
Interno(a) - 2380775 - CICERO CARLOS DE SOUZA ALMEIDA
Interno(a) - 2187545 - FLAVIA DE BARROS PRADO MOURA
Interno(a) - 1181648 - JOSE VIEIRA SILVA