Banca de DEFESA: ELLEN KAROLLYNE SANTOS LOPES

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : ELLEN KAROLLYNE SANTOS LOPES
DATA : 30/08/2023
HORA: 14:00
LOCAL: Auditório do Crad - UFAL Arapiraca
TÍTULO:

GENOMA FUNCIONAL DE Spondias tuberosa Arr. Cam. (umbu)

PALAVRAS-CHAVES:

Biologia molecular. Anotação funcional. Genética.

PÁGINAS: 50
RESUMO:

A Spondias tuberosa Arr. Cam. (umbu) é uma espécie de árvore conhecida no nordeste
brasileiro por ser uma alternativa e recurso econômico brasileiro em regiões do semiárido.
Pensando em realizar a anotação funcional do genoma da espécie, o presente estudo
objetivou-se em apresentar a quantidade de genes envolvidos nos processos biológicos, nos
componentes celulares e na função molecular, além disso, os códigos de enzimas e as vias
metabólicas. Para isso, o DNA foi extraído pelo método de long reads usando Pacbio
Assembly. Após detectar estruturas repetitivas, usando o GeneMask, a anotação estrutural foi
montada usando preditores de genes ab initio (Augustus e GeneMarker) e inteligência
artificial (Helixer), para a qualificação da montagem do genoma, a ferramenta BUSCO foi
utilizada. A anotação funcional obteve os dados gerados pela plataforma Blast2GO, os genes
foram anotados usando as categorias Gene Orthology (GO), além de enzimas e vias
metabólicas. A avaliação do BUSCO na montagem gerada pelo Helixer resultou em uma
precisão de 98% de completude. Os genes previstos foram distribuídos em 51.896 termos GO
totais, distribuídos em três categorias principais: função molecular, processo biológico e
componente celular. As enzimas foram distribuídas em 7 categorias e as vias metabólicas em
5 categorias. No presente estudo, notou-se que os genes do processo biológico envolvidos na
resposta ao estresse resultaram na maior quantidade de genes para esta categoria no genoma
de S. tuberosa. Revelando também que a quantidade de genes envolvidos na resposta ao
estresse se mostra maior que as demais espécies da mesma família.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 2380775 - CICERO CARLOS DE SOUZA ALMEIDA
Interno(a) - 1181648 - JOSE VIEIRA SILVA
Externo(a) à Instituição - MARCILIO DE SOUZA SILVA - IFAL