Integração de dados de single cell RNA e transcriptoma espacial para investigação da
invasão perineural e do ritmo circadiano no adenorcarcinoma de pâncreas
scRNA, pâncreas, spatial transcriptomics
O adenocarcinoma ductal pancreático (PDAC) é marcado por sua natureza agressiva e prognóstico desfavorável, com a invasão perineural (PNI) contribuindo significativamente para sua gravidade clínica. Este estudo utiliza dados de sequenciamento de RNA de célula única (scRNA-seq) para analisar as complexidades moleculares da PNI no PDAC, concentrando-se no papel das Células Ductais Pancreáticas (PDCs) e genes críticos - SPP1, IGFBP3, PLAU e POSTN. A análise das redes de comunicação intercelular por meio do CellChat revela um padrão de sinalização distinto em tumores PNI-positivos, enfatizando a importância das PDCs e das células mieloides. A análise hierárquica da rede de coexpressão gênica ponderada (hdWGCNA) identifica módulos associados a processos celulares fundamentais, com o Módulo M5 destacando-se por seu envolvimento na apresentação de antígenos e na modulação imunológica. Genes essenciais dentro do M5, incluindo MDK, ITGB1, THY1, SFRP2, HLA-A e DYNLL1, acrescentam complexidade ao nosso entendimento, sugerindo papéis cruciais na formação do comportamento das PDCs. A análise de pseudotempo revela mudanças temporais dinâmicas, destacando maior plasticidade celular e vias de resposta inflamatória em amostras PNI-positivas. Os genes essenciais exibem padrões de expressão distintos: SPP1 destaca seu papel no fenótipo invasivo do PDAC, IGFBP3 sugere contribuições para a rede regulatória, PLAU implica na remodelação da matriz extracelular e POSTN sugere envolvimento na criação de um nicho favorável.