Cenário atual das begomoviroses em solanáceasna região nordeste do Brasil
Solanaceae; Begomovirus; Diversidade genética.
A família Solanaceae possui grande importância ecológica e econômica. As espécies como Solanum lycopersicon (tomate), S. tuberosum (batata inglesa), S. melongena (berinjela) e Capsicum annuum (pimentão) são conhecidas por serem nutricionalmente significativas, enquanto Nicotiana tabacum (tabaco) é conhecida por suas propriedades medicinais. Batata e tomate estão entre as culturas mais cultivadas globalmente, sendo também destacadas no Brasil. A produtividade dessas culturas é afetada por vários fatores, incluindo a presença de begomoviroses (Família Geminiviridae, gênero Begomovirus). No Brasil, os vírus Tomato severe rugose virus (ToSRV), Tomato mottle leaf curl virus (ToMoLCV) e Sida micranta mosaic virus (SiMMV) são predominantes em culturas de batata, berinjela, pimentão, tabaco e tomate. Este projeto tem como objetivo analisar a diversidade de begomovírus em solanáceas no Nordeste do Brasil, caracterizando-os molecularmente e avaliando seu impacto agrícola. O DNA total será extraído de cada amostra e utilizado na detecção dos begomovírus ToSRV, ToMoLCV e SiMMV por meio de PCR com primers espécie-específicos. Amostras negativas serão submetidas à detecção por PCR usando primers específicos para o gênero Begomovirus. Após a identificação de begomovírus, o DNA total será enriquecido via Rolling Circle Amplification (RCA) e os produtos de RCA serão enviados para High Throughput Sequencing (HTS) na empresa LACTAD. As sequências dos genomas virais completos serão demarcadas em nível de espécies com o programa Species Demarcation Tool (SDT). A relação entre as espécies obtidas e outros begomovírus do GenBank será determinada por filogenia Bayesiana no Web Portal CYPRES. Por fim, eventos de recombinação entre as espécies serão analisados com o pacote computacional RDP4.
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