Banca de DEFESA: ALINE MARQUES MELO

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : ALINE MARQUES MELO
DATA : 29/02/2024
HORA: 14:00
LOCAL: Defesa online
TÍTULO:

VARIABILIDADE GENÉTICA E ESTRUTURA POPULACIONAL DE Macroptilium yellow vein virus EM Macroptilium spp. NO ESTADO DE ALAGOAS E PRIMEIRO RELATO DE Macroptilium yellow net virus EM Rhynchosia minima

PALAVRAS-CHAVES:

Geminivírus, Fabaceae, planta daninha

PÁGINAS: 60
RESUMO:

Plantas não cultivadas possuem um importante papel como fonte de diversidade de begomovírus, podendo contribuir para emergência de novas espécies e ainda servirem como hospedeiros alternativos ou como fonte de inóculo para epidemias em culturas comerciais. Begomovirus (família Geminiviridae) são um importante gênero de vírus que infectam dicotiledôneas nas mais diversas regiões do planeta, causando significativas perdas econômicas em campos de cultivo. Neste contexto, o presente estudo tem como objetivo avaliar a variabilidade genética e estrutura populacional de Macroptilium yellow vein virus (MaYVV) infectando Macroptilium spp. no estado de Alagoas e a identificação da espécie de begomovírus infectando Rhynchosia mínima. Visando avaliar a variabilidade genética e a estrutura populacional de MaYVV infectando a planta não-cultivada Macroptilium sp. (família Fabaceae), amostras foliares apresentando sintomas indicativos de infecção por begomovírus foram coletadas em diferentes municípios do estado de Alagoas em 2019 e 2020. O DNA total foi extraído a partir de cada amostra e serviu como molde para amplificação por círculo rolante (RCA), em seguida clonado em vetores plasmidiais e completamente sequenciado. Comparações de sequências pareadas do DNA-A mostraram que todos os isolados pertencem a uma única espécie: MaYVV. Análise filogenética mostrou a divisão dos isolados de MaYVV em cinco subpopulações, as quais apresentaram baixos valores de variabilidade nucleotídica. Análise de recombinação e análise reticulada mostraram evidências de eventos de recombinação intraespecífica nos isolados de MaYVV. Foi detectada forte pressão de seleção negativa atuando sobre os genes CP e Rep de MaYVV. Os resultados obtidos sugerem uma baixa variabilidade genética que pode ter sido gerada por possíveis gargalos genéticos e que há forte estruturação geográfica das subpopulações, sugerindo que está acontecendo pouca interação entre elas e que estas podem continuar se diferenciando. Para identificar a espécie de begomovírus infectando Rhynchosia minima, foi realizada a extração do DNA total das plantas que apresentavam sintomas de infecção por begomovírus. Alíquotas do DNA foram utilizadas para realizar a identificação a nível de gênero através da reação em cadeia da polimerase (PCR). As amostras positivas para o gênero foram utilizadas para obter genomas virais completos por meio da amplificação por círculo rolante (RCA), clonados em vetores plasmidiais e completamente sequenciados. Um total de quatro clones foram obtidos.  Comparações de sequências pareadas (SDT) indicaram que os clones possuíam 94% de identidade com Macroptilium yellow net virus (MaYNV), um isolado pertencente a espécie Tomato interveinal chlorosis virus (ToICV). A análise filogenética mostrou que os isolados formaram um clado com MaYNV e ToICV, corroborando com o resultado do SDT. Rhynchosia minima já foi descrita como hospedeira de begomovírus em países como Equador, Porto Rico, Estados Unidos, Cuba, México e Paquistão, mas ainda não havia sido descrita no Brasil, sendo este o seu primeiro relato.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1369412 - GAUS SILVESTRE DE ANDRADE LIMA
Interno(a) - 1790557 - GILDEMBERG AMORIM LEAL JUNIOR
Interno(a) - ***.040.974-** - MARIOTE DOS SANTOS BRITO NETTO - UFRPE
Interno(a) - 2149632 - SARAH JACQUELINE CAVALCANTI DA SILVA
Externo(a) ao Programa - 3339094 - MAYRA MACHADO DE MEDEIROS FERRO - UFALExterno(a) à Instituição - ROBERTO RAMOS SOBRINHO